Los barrios originales de El Pepino eran hatos o criaderos de ganado mayor o menor, por lo tanto, eran núcleos poblacionales. Para el siglo XIX (1800) es que comienzan a surgir los primeros cinco barrios con una jurisdicción territorial definida. Estos barrios fueron Guacio, Sonador, Caimitos, Cibao y Pueblo. El surgimiento de nuevos partidos aledaños diezmó parte del territorio pepiniano. Parte de Añasco, Mayagüez y Lares pertenecieron una vez a El Pepino. Aunque estas nuevas demarcaciones perdieron parte de su territorio, con todo y esto se fueron subdividiendo hasta conformar el abanico barrial pepiniano que cuenta, hoy día, con 23 barrios rurales y uno urbano.
Los barrios son los verdaderos iniciadores del desarrollo social, económico y político de los futuros municipios. Con el tiempo, el barrio cabecera urbano disipó en las sombras la importancia de los barrios rurales porque éstos le confirieron el papel preponderante que tiene ahora.
Estos apuntes barriales, además de sus objetivos didácticos, tienen la intención de provocar que se levanten los pobladores de los barrios para reconstruir su historia, historia que ha forjado el pueblo-etnia de San Sebastián del Pepino.
Aibonito
Barrio localizado en la meseta de la Comarca Norte de El Pepino. Su área geográfica es de 4.4 millas cuadradas. Es el tercero en extensión territorial. Según el censo de 2000 tiene una población de 2116 habitantes. Voz indígena que se refiere a la belleza del paisaje. Jatibonico, de donde sale su nombre significa río de la noche. Aquí nace el poético Río Guatemala.
Alto Sano
Barrio localizado en la Comarca Sur de El Pepino. Su área geográfica es de 2.3 millas cuadradas. El censo del año 2000 indica que tiene 1282 habitantes.Originalmente el nombre se escribía Altozano que significa monte de poca altura en un sitio llano. Por sus inmediaciones discurre la Quebrada Altozano. En este barrio se dan copiosas lluvias y de producen trueno ensordecedores. El terreno de este barrio ha sido muy pródigo y abunda el cultivo de frutos menores, principalmente el ñame de guinea.
La ciudad valenciana de Alicante tiene un barrio con el nombre de Altozano. El Alto Sano pepiniano tiene la celebración de las fiestas de la candelaria a principios del mes de febrero auspiciadas por La Vanguardia Juvenil.
Arenas
Antiguo barrio del sur, localizado en la Comarca Sur de El Pepino. Su nombre viene de las partículas disgregadas de roca arrastradas por el Río Guacio y depositadas en sus contornos. Surge de la división de Guacio cerca de 1846. Pasó a Las Marías cuando éste se hizo municipio. El Río Guacio, en la actualidad, discurre por el norte de su territorio
Bahomamey.
Barrio localizado en la Comarca Sur de El Pepino. Tiene voz indígena, Babumamey, babu es una voz africana y mamey es el nombre de un árbol cuyo fruto es, precisamente, el mamey. Para 1707 era un hato localizado en la falda noroeste del mogote Pepinito.Es el más pequeño de los barrios con 0.77 millas cuadradas. El censo del año 2000 le asigna una población de 2740.
